當院は、浄土宗祖法然上人御生家漆間（うるま）家の菩提寺で貞観4年（西暦862年）平安時代の初期、比叡山延暦寺第3代座主阿弥陀念佛の祖、慈覚大師円仁を勧請開山上人と仰ぎ開創された。その当時は現在の誕生寺（元漆間家邸宅）の前にあって、遍く十方の信徒の帰依篤く欣求浄土の崇信をあつめていた。

建久4年（西暦1194年）熊谷蓮生法師により、漆間家館が寺院に改められた際、浄土院は「誕生寺」と称するようになった。当時、現在浄土院の建つ場所に「岡の坊」と称する塔頭寺院があったものを元和年中（江戸時代初期）心譽文徹大徳により浄土院を復興し、現在に至ったものである。堂内には、法然上人御自筆と伝えられるご両親様（漆間時国公、秦氏君）霊牌が祀られている。

昭和57年、宗祖法然上人御誕生850年慶讃会を迎えるに当たり、上人御両親様御遺 徳顕彰・追恩御菩提の為、浄土院第30世敬譽坤爾上人により新たに六角堂霊牌殿 （本堂）を建立した。そして、平成23年宗祖法然上人800年大遠忌を迎えるにあたり、法然上人御両親様850回忌追善御菩提と法然上人800年大遠忌記念事業として、平成13年、浄土院第31世光譽宣隆により、新たに客殿・庫裡を建立した。